Temel fark, LXC konteynerlerinin (çekirdek hariç) eksiksiz bir Linux sistemini sanallaştırması (sistem konteynerleri) iken, Docker'ın bireysel uygulamaları sanallaştırmak (uygulama konteynerleri) için tasarlanmış olmasıdır.
Docker'ın altında, ek işlevsellik sağlayan, daha büyük kurulumlarda (Kubernetes vb.) daha iyi ölçeklenebilen, CI/CD'ye daha kolay entegrasyon sağlayan ve yeni konteynerlerin dağıtımını kolaylaştıran Docker Engine adlı ek bir ara katman da bulunmaktadır.
Daha büyük uygulamalar genellikle, her biri kendi mikro hizmetine sahip, başlangıçta bağımsız olan ve bir ağ üzerinden birbirleriyle iletişim kuran birçok konteynerden oluşur. Platform, gerekirse bulut ortamında ek konteyner örneklerinin dinamik olarak oluşturulması da dahil olmak üzere yük dengelemesini yönetir.
LXC, donanıma daha yakındır ve genellikle daha hızlı çalışır.
Özel olarak geliştirilen uygulamalar için Docker, çok çeşitli önceden oluşturulmuş konteynerlere erişebilme, bunları Compose kullanarak kendi kodunuzla çekici bir şekilde genişletebilme ve ardından doğrudan bir test veya üretim sistemine dağıtabilme avantajına sahiptir. Bildiğim kadarıyla, LXC konteynerlerinde bu kadar kolay değil.
Not: Docker/Podman ile birkaç kez çalıştım, ancak LXC konteynerlerini sadece küçük bir test kurulumundan biliyorum, bu yüzden onlarla ilgili çok fazla deneyimim yok.